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BN 7.6微生物分析软件疾控专用可接TraNet

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品牌: BioNumerics
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最后更新: 2023-10-30 15:09
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我公司为Bionumerics 中国区域代理商,Bionumerics 是一款集数据存储与分析功能于一体的生物信息分析软件,集成多种统计及分析算法,实现多类型生物数据的聚类与挖掘分析。软件很好的满足了研究机构或诊断机构对不同的生物学数据进行分析的要求。这套软件系统已经得到了很多研究机构,包括疾控中心,大学,医院,公共医疗中心,食品,药物和制药企业等各种实验室的广泛认可。

BioNumerics是一款用户友好型、专为微生物全基因组分型设计的、无需专业的生物信息学技能即可使用的自动化数据分析解决方案,可以应用于暴发、耐药、毒力等细菌基因组分析中,目前已经被众多研究学者应用于细菌全基因组分型(如cgMLST)数据分析该软件可以处理微生物 NGS和Sanger 序列数据,软件包含从测序原始数据导入,拼接及分析的一系列自动化工具,因此微生物学者可以将NGS全基因组测序技术和 Ridom SeqSphere+ 软件自动化数据分析解决方案轻松应用于微生物全基因组分型的日常研究工作中。

​Fingerprint Types 指纹类型 可以对凝胶图谱、自动测序仪数据、实验芯片系统的电泳指纹图谱等进行标准化处理和分析,如PFGE、MALDI光谱数据的预处理和分析;同时该模块也被应用于AFLP、RFLP、RAPD、REP-PCR、ARDRA、IEF、DGGE、TGGE等技术方法和实验数据分析中。用户可以创建一个凝胶电泳(PFGE)实验类型,根据实验需求设定biomark,标记分子量,自动搜索条带,进行条带相似度的设置,相似系数和聚类分析等。模块一个重要的创新是可以根据参考系统对条带的位置,图像进行即时的标准化处理,可以自动把参考系统的参考值映射到其它任何图谱上。这样,在不同条件下用不同的参考标记生成的图像,把它们放在一起显示,条带可以完美地匹配在一起。
Character Types 特征类型 用特征字符型数据,用户可以定义任何特征字符;利用矩阵类型数据,可以导入外部的相似矩阵或距离矩阵。在多位点VNTR分析(MLVA)中,该模块提供了自动化的分析流程;特征类型的例子还包括脂肪酸数据矩阵,代谢消化或酶活性检测,包括抗生素耐药谱、API、Biolog、Vitek、形态学和生化特性、微阵列和基因芯片等。BioNumerics里面的特征字符型数据的大小可以是单个特征,也可以是基因芯片试验的成千上万的基因表达值。矩阵可以和BioNumerics里的其它数据库的记录相连,从而关联起来得到用户想要的分类和鉴定,此种数据的典型例子是DNA同源性相似度的表格。
Sequence Types 序列类型 用户可以输入核酸和氨基酸序列,组合和分析Sanger序列数据和NGS序列读取,使用各种各样的序列分析、搜索和校准及比较工具;基于核酸序列的测定,该模块常用于多位点序列分型(multilocussequence typing,MLST)中;Bionumerics可以广泛的识别各种序列格式,包括EMBL、GenBank和Fasta格式。它整合了对成千上万的长度不限的核苷酸或蛋白序列的多序列比对,并能显示同源矩阵。用户能够根据自己的需求设定特定的比对的参数;同时可以对根据多序列比对产生的系统发生树进行人工的修改,或对特定的部分序列构建树。这个模块的功能包含了分子分析工具模块,能够进行开放读码框架分析,预测蛋白序列;限制性酶切分析,引物设计等。
Trend Data Types 趋势数据类型 在代谢及酶活性的动力学分析、生长曲线、实时PCR或者用微阵列做的时间过程实验中,虽然一个实验有多个输入大部分是以时间为方程做的,但是它们也可能基于其它的参数,比如基于不同浓度的方程。该模块提供了十二种不同的曲线拟合模型,基于这些模型,可以推出特异的参数,也可以用于分析及比较。用户也可以加入自己的参数比如统计参数、斜率及在某一固定X的值等。
金先生 13552183571
安装调试:现场安装软件,并对客户培训
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